Segunda Fase: se disputará en dos (2) Zonas (“A” y “B”), de 11 equipos cada uno. La Zona “A” será integrada por los equipos ubicados en los puestos 1°, 3°, 5°, 7°, 9°, 11°, 13°, 15°, 17°, 19° y 21° de la Tabla Final de Posiciones de la “Primera Fase”, mientras que la Zona “B” estará conformada por los clubes ubicados en los puestos 2°, 4°, 6°, 8°, 10°, 12°, 14°, 16°, 18°, 20° y 22° de la Tabla Final de Posiciones de la “Primera Fase”.

 Al término de la disputa de estos partidos, el equipo ubicado en el 1er. puesto de cada una las Zonas, disputarán la Final. Este partido se disputará a un solo partido, en estadio neutral. Si al cabo de los 90 minutos reglamentarios, el resultado fuera empate, la definición se operará mediante la ejecución de tiros desde el punto penal.

 El vencedor de este encuentro será declarado ganador de la Segunda Fase de la Tercera División de Primera División “B” 2024 y jugará la final anual ante el ganador de la Primera fase (FLANDRIA).
 ZONAS DE LA SEGUNDA FASE
 ZONA A: ARGENTINO DE MERLO / ARGENTINO DE QUILMES / COMUNICACIONES / DEPORTIVO ARMENIO / DEPORTIVO MERLO /  FENIX / FLANDRIA / LOS ANDES / SACACHISPAS / UAI URQUIZA / VILLA SAN CARLOS.
 ZONA B: ACASSUSO / CAÑUELAS / COLEGIALES / DEPORTIVO MERLO / DOCK SUD / EXCURSIONISTAS / LAFERRERE / LINIERS / MIDLAND / SAN MARTIN / VILLA DALMINE